يهدف القسم إلى جعل الطالب :
- قادراً على فهم المصطلحات التشريحية واستعمالها بصورة صحيحة .
- معرفة التشريح السطحي والداخلي لجسم الإنسان .
- معرفة التركيب الدقيق لأجهزة وأنسجة الجسم المختلفة.
- معرفة عملية تكوين الإنسان بصورة طبيعية والعيوب الخلقية الممكن حدوثها .وذلك من خلال اشتراك الطالب في التشريح العملي ودراسة لأجزاء سابقة التشريح وعينات موجودة بمتحف القسم .
بالإضافة لذلك يقوم أعضاء هيئة التدريس باجراء البحوث الطبية ونشرها بالمجلات العلمية والمؤتمرات المعنية .